1905年9月 出生于江苏省苏州市。
1923年 考入复旦大学。
1925年 参加“五卅”运动。是年冬，与袁世凯孙女袁慧泉结婚。
1926年6月 毕业于复旦社会科学科大学政治学系。自费学习外语2年。
1928年 赴法留学。
1929年转入英国牛津大学主攻政治经济学获硕士学位。
1931年，费巩毕业，取道苏联回国，在中国公学任教。九一八事变后，回国任《北平日报》社评委员。
1932年 回复旦大学任教，讲授中国的政治制度。
1933年秋 应聘到浙江大学任教，讲授政治经济学和西洋史，并兼注册课主任。
1935年 “一二.九”运动时，他支持学生的抗日救亡活动，多次保护中共党员及进步学生。抗日战争爆发后，费巩随浙大内迁至贵州遵义。
1940年8月 出任训导长，受到教师和学生的爱戴。坚决不加入国民党。他在浙大推行导师制，从学业、生活和思想上多方面关心教育学生。
1944年2月起连续撰文和演讲，抨击国民党的腐败统治，要求废止国民党一党专政，赞成中国共产党提出的成立联合政府的主张。还多次公开演讲，申明政治主张。
1945年1月，费巩应邀赴重庆复旦大学讲授民主与法制。2月，他在重庆文化界《对时局进言》上签字。为了讲课和著述，他广泛调查国民政府的腐败情况。3月5日凌晨，费巩准备到北碚复旦大学讲学，在重庆千厮门码头遭国民党特务秘密绑架遇害，尸体被投入硝镪水中化掉。
解放后，党和政府非常重视费巩失踪案件的调查，也非常关怀费巩的家属。1950年，华东军政委员会专门派员到费家慰问，并带来周总理的问候和总理亲自批示的优抚金。
1978年9月5日，上海市政府正式追认费巩为革命烈士。